20世紀(jì)90年代初，華東師范大學(xué)明確“正確定位，辦出師范特色”的辦學(xué)思想，提出走師范性與學(xué)術(shù)性相統(tǒng)一的道路。1995年，學(xué)校第九次黨代會(huì)提出今后的工作任務(wù)是努力探索學(xué)校綜合改革新路，把學(xué)校建設(shè)成為國(guó)內(nèi)領(lǐng)先、國(guó)際有影響的社會(huì)主義師范大學(xué)。學(xué)校進(jìn)入“211工程”國(guó)家重點(diǎn)建設(shè)大學(xué)行列。通過(guò)與上海市項(xiàng)目共建，實(shí)現(xiàn)部市共建共管、以上海為主的新體制。推進(jìn)職前職后一體化的教師教育新體系構(gòu)建，從單項(xiàng)改革走向更高層次的綜合改革。
改革校內(nèi)管理體制。1993年初，學(xué)校開(kāi)始實(shí)行校、院、系三級(jí)管理、以院為實(shí)體的管理體制，并以學(xué)院為單位開(kāi)展專(zhuān)業(yè)、學(xué)科建設(shè)和改造，人員定編，工資總額動(dòng)態(tài)包干，專(zhuān)業(yè)技術(shù)職務(wù)評(píng)審、聘任，實(shí)驗(yàn)室建設(shè)和各項(xiàng)經(jīng)費(fèi)管理等工作。陸續(xù)建立了國(guó)際商學(xué)院、理工學(xué)院、文學(xué)與藝術(shù)學(xué)院、外語(yǔ)學(xué)院、環(huán)境與資源科學(xué)院、人文學(xué)院、化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院和教育科學(xué)與技術(shù)學(xué)院等八大實(shí)體學(xué)院。
改革教學(xué)管理制度。從1993年開(kāi)始，學(xué)校改學(xué)年學(xué)分制為學(xué)分制，打破專(zhuān)業(yè)限制，拓寬學(xué)生知識(shí)面，全面推廣并逐步擴(kuò)大主輔修制。加強(qiáng)特色與主干課程的建設(shè)，完善教材的配套改革，選出六門(mén)課程作為學(xué)校首批特色課程立項(xiàng)建設(shè)。設(shè)立大學(xué)生科研基金，設(shè)立教學(xué)改革基金，加強(qiáng)教師隊(duì)伍建設(shè)，實(shí)施“百人工程”，使各學(xué)科的人員梯隊(duì)漸趨合理。學(xué)校實(shí)施院士工程，1999年6月引進(jìn)中國(guó)工程院院士喬登江到物理系工作。同年12月，陳吉余教授當(dāng)選中國(guó)工程院院士，成為學(xué)校第一位當(dāng)選院士的教師。繼1995年國(guó)家教委批準(zhǔn)中文、歷史系為國(guó)家文科基礎(chǔ)學(xué)科人才培養(yǎng)與科學(xué)研究基地之后，又批準(zhǔn)設(shè)立數(shù)學(xué)、心理學(xué)、地理學(xué)三個(gè)理科基礎(chǔ)學(xué)科人才培養(yǎng)與科學(xué)研究基地。同時(shí)生態(tài)學(xué)、教育學(xué)、世界歷史、世界經(jīng)濟(jì)學(xué)被確認(rèn)為上海市的重點(diǎn)學(xué)科。
改革招生、畢業(yè)分配制度。學(xué)校實(shí)行自主招生和非師范專(zhuān)業(yè)繳費(fèi)上學(xué)的改革，實(shí)行畢業(yè)分配“中期改革”方案，較好地完成國(guó)家下達(dá)計(jì)劃的畢業(yè)生分配工作。在改革科研工作運(yùn)行機(jī)制方面，學(xué)校提高科研專(zhuān)職編制的浮動(dòng)比例，實(shí)行有償使用專(zhuān)職科研編制；加強(qiáng)科研經(jīng)費(fèi)的宏觀(guān)管理，調(diào)整科研經(jīng)費(fèi)分配辦法，鼓勵(lì)科研人員多接課題。在改革后勤管理方面，學(xué)校對(duì)部分服務(wù)部門(mén)進(jìn)行招標(biāo)承包，轉(zhuǎn)換經(jīng)營(yíng)機(jī)制，完善承包責(zé)任制,提高經(jīng)濟(jì)效益。學(xué)校多規(guī)格、多層次、多渠道辦學(xué)，教育管理學(xué)院擴(kuò)展培訓(xùn)領(lǐng)域，與香港有關(guān)方面合作，聯(lián)合舉辦多期香港中學(xué)校長(zhǎng)培訓(xùn)班。成人教育拓展業(yè)務(wù)范圍，1993年學(xué)校建立全國(guó)第一個(gè)“成人教育”碩士點(diǎn)。高師師資培訓(xùn)形成新特色，建立普通教育研究中心和一批普通教育研究基地，遍布上海多個(gè)區(qū)縣。學(xué)校轉(zhuǎn)換辦學(xué)機(jī)制，與上海市有關(guān)企事業(yè)單位實(shí)行項(xiàng)目共建，合作辦學(xué)。建立東方房地產(chǎn)學(xué)院、遠(yuǎn)東國(guó)際金融學(xué)院、階梯學(xué)院、長(zhǎng)江流域發(fā)展研究院、華夏學(xué)院、工商管理學(xué)院、華茂學(xué)院、銀行學(xué)院等。
1996年4月25日，我校通過(guò)教育部“211過(guò)程”部門(mén)預(yù)審，成為“211工程”建設(shè)高校
1996年，學(xué)校參與上海市師范結(jié)構(gòu)調(diào)整。1997年9月，上海幼兒師范高等專(zhuān)科學(xué)校并入，成立學(xué)前與特殊教育學(xué)院。1998年9月，上海教育學(xué)院、上海第二教育學(xué)院并入之后，組建繼續(xù)教育學(xué)院和職業(yè)技術(shù)學(xué)院，開(kāi)始構(gòu)建職前職后一體化的教師教育新體系。
1996年4月，學(xué)校通過(guò)國(guó)家“211工程”預(yù)審，1997年5月20日，國(guó)家教委和上海市政府決定共建華東師范大學(xué)。至20世紀(jì)末，學(xué)校已有11個(gè)實(shí)體學(xué)院和若干非實(shí)體學(xué)院，學(xué)校在職教工4500余人，在校生近33000人，校園面積近1200畝。
