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• 河口海岸全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 精密光譜科學(xué)與技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 石油化工分子轉(zhuǎn)化與反應(yīng)工程全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 國(guó)家可信嵌入式軟件工程技術(shù)研究中心

• 浙江天童森林生態(tài)系統(tǒng)國(guó)家野外科學(xué)觀(guān)測(cè)研究站

• 可信軟件國(guó)際聯(lián)合研究中心

• 腦功能基因組學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 地理信息科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 極化材料與器件教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 青少年健康評(píng)價(jià)與運(yùn)動(dòng)干預(yù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 統(tǒng)計(jì)與數(shù)據(jù)科學(xué)前沿理論及應(yīng)用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 數(shù)學(xué)與工程應(yīng)用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（籌）

• 納光電集成與先進(jìn)裝備教育部工程研究中心
• 軟硬件協(xié)同設(shè)計(jì)技術(shù)與應(yīng)用教育部工程研究中心
• 區(qū)塊鏈數(shù)據(jù)管理教育部工程研究中心（籌）

• 全球創(chuàng)新與發(fā)展研究院

• 可信軟件國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室
• 綠色大河三角洲國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室（籌）

• 長(zhǎng)江三角洲河口濕地生態(tài)系統(tǒng)教育部野外科學(xué)觀(guān)測(cè)研究站

• 華東師范大學(xué)中國(guó)行政區(qū)劃研究中心

• 課程與教學(xué)研究所
• 中國(guó)現(xiàn)代思想文化研究所
• 俄羅斯研究中心
• 中國(guó)文字研究與應(yīng)用中心
• 基礎(chǔ)教育改革與發(fā)展研究所
• 中國(guó)現(xiàn)代城市研究中心

• 智能教育實(shí)驗(yàn)室

• 職業(yè)教育教材建設(shè)和管理政策研究基地
• 中小學(xué)地理教材研究基地

• 民族與發(fā)展研究院

• 澳大利亞研究中心
• 美國(guó)研究中心
• 白俄羅斯研究中心
• 周邊國(guó)家研究院
• 中東歐研究中心
• 中亞研究中心

• 國(guó)家智能社會(huì)治理實(shí)驗(yàn)基地教育特色基地
• 國(guó)家智能社會(huì)治理實(shí)驗(yàn)基地養(yǎng)老特色基地

• 全國(guó)普通高校中華優(yōu)秀傳統(tǒng)文化傳承基地（篆刻）

• 華東師范大學(xué)老齡科研基地（人口老齡化與老年問(wèn)題研究）
• 國(guó)家語(yǔ)委研究型基地全球中文發(fā)展研究中心
• 國(guó)家教師發(fā)展協(xié)同創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)基地暨國(guó)家級(jí)教師培訓(xùn)管理者發(fā)展研究中心
• 團(tuán)中央中國(guó)特色社會(huì)主義理論體系研究華東師范大學(xué)研究基地
• 國(guó)家新聞出版署出版智庫(kù)上海出版研究院
• 國(guó)家新聞出版署出版融合發(fā)展（華東師大社）重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 自然資源部超大城市自然資源時(shí)空大數(shù)據(jù)分析應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 自然資源部大都市區(qū)國(guó)土空間生態(tài)修復(fù)工程技術(shù)創(chuàng)新中心
• 自然資源部浙江舟山島嶼生態(tài)系統(tǒng)野外科學(xué)觀(guān)測(cè)研究站（籌）

• 上海市腦功能基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市綠色化學(xué)與化工過(guò)程綠色化重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市磁共振重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市高可信計(jì)算重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市調(diào)控生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市核心數(shù)學(xué)與實(shí)踐重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市多維度信息處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
• 上海市心理健康與危機(jī)干預(yù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

• 上海分子治療與新藥創(chuàng)制工程技術(shù)研究中心
• 上海數(shù)字化教育裝備工程技術(shù)研究中心
• 上海有機(jī)固廢生物轉(zhuǎn)化工程技術(shù)研究中心

• 長(zhǎng)江三角洲河口濕地生態(tài)系統(tǒng)上海市野外科學(xué)觀(guān)測(cè)研究站

• 上海市基因編輯與細(xì)胞治療前沿科學(xué)研究基地
• 上海市分子智造前沿科學(xué)研究基地

• 上海市可信工業(yè)互聯(lián)網(wǎng)軟件協(xié)同創(chuàng)新中心

• 上海市大數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)工程研究中心

• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地曾剛工作室（方向：長(zhǎng)三角區(qū)域一體化）
• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地余南平工作室（方向：國(guó)際戰(zhàn)略與上海發(fā)展）
• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地吳瑞君工作室（方向：上海人口結(jié)構(gòu)和發(fā)展趨勢(shì)方向）
• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地馮學(xué)鋼工作室（方向：都市旅游與服務(wù)管理）
• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地汪榮明、殷德生工作室（方向：大數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與金融風(fēng)險(xiǎn)管理）
• 上海市人民政府決策咨詢(xún)研究基地杜德斌工作室（方向：城市與區(qū)域創(chuàng)新）
• 上海市"黨的執(zhí)政能力建設(shè)"社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市"教育強(qiáng)國(guó)的教育公平研究"社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想研究中心（華東師范大學(xué)研究基地）
• 國(guó)家教育宏觀(guān)政策研究院（上海市重點(diǎn)智庫(kù)）
• 上海市“中國(guó)教育學(xué)學(xué)術(shù)話(huà)語(yǔ)體系與創(chuàng)新研究”社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市“中國(guó)歷史學(xué)話(huà)語(yǔ)體系建設(shè)與國(guó)際傳播”社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市“中國(guó)特色的轉(zhuǎn)型社會(huì)學(xué)研究”社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市“中國(guó)發(fā)展道路的政治經(jīng)濟(jì)學(xué)”社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地
• 上海市“中國(guó)詮釋學(xué)”社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地

• 周邊合作與發(fā)展協(xié)同創(chuàng)新中心
• 上海城市發(fā)展協(xié)同創(chuàng)新中心
• 全球創(chuàng)新與發(fā)展研究院
• 電競(jìng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究中心

• 上海市語(yǔ)文教育教學(xué)研究基地
• 上海市體育教育教學(xué)研究基地
• 上海市地理教育教學(xué)研究基地
• 上海市課程教育教學(xué)研究基地
• 上海市心理教育教學(xué)研究基地
• 上海市生命科學(xué)教育教學(xué)研究基地
• 上海市數(shù)學(xué)教育教學(xué)研究基地
• 上海市信息科技教育教學(xué)研究基地
• 上海市通用技術(shù)教育教學(xué)研究基地
• 上海市基礎(chǔ)教育教材建設(shè)重點(diǎn)研究基地

• 上海市美國(guó)創(chuàng)新與發(fā)展研究中心